El Museo de la Ciudad fue inaugurado en 1998 en las instalaciones del Antiguo Hospital San Juan de Dios, una de las edificaciones civiles más antiguas de Quito, donde se brindó servicios de salud a la ciudadanía hasta 1974, año en el que cerró sus puertas, para luego ser restaurado y convertido en museo. A través de siete salas de exposición permanente se visibilizan los procesos históricos y socio culturales que ha vivido Quito desde hace 10.000 años atrás hasta el siglo XX.

Desde su creación el museo se consolidó como un importante punto de encuentro para el diálogo, la reflexión y el debate intercultural e intergeneracional, a través de las diferentes temáticas desarrolladas en sus exposiciones; permanentes, temporales e itinerantes, así como de la programación artística y cultural anual y su programa de mediación comunitaria. Actualmente, el museo se concibe una plataforma cultural que genera experiencias museológicas a través de la educación no formal. Impulsa el uso del tiempo libre, el diálogo y la reflexión en torno a los procesos históricos y socio culturales del Distrito Metropolitano de Quito.